然，也正是因为董卓当初没有想到马超进攻长安的决心，昏头昏脑的派出这些私兵炮灰，才导致马超仅用了一天的时间，便攻克了外城，占据了有利的战略位置。
董卓残部的将士们，在战后还有五万多人。对这些将士，马超依旧是遵循着之前他亲自制定的规则，心存忠义的，录入军中，从最底层的士卒开始做起；而心术不正的，则是予以遣散，令他们去自谋生路；至于心生邪念的，不用说，对待此种败类，马超的做法，从来都是在他们脆弱的脖颈上痛快的赏赐一刀，送他们下地狱去接受惩罚。最后，马超在数万降军中，筛选出了近两万名可用的士卒，编入了自己的军队中，此外还选出了七千名青壮劳力，交给了俄何烧戈，由他带回草原区，充当牧区的劳动力，促进牧区的经济发展。
借着整编降军的机会，马超还大刀阔斧的对长安城中，已经名存实亡的各个势力进行了整顿。马超以冠军侯之名，以开府仪同三司的权力，将长安城中的士族全部除名，不但废除了他们所拥有的特权，还没收了他们的土地，并对这些土地进行了再分配，让大片的土地重新回到了劳动人民的手中。
很久之前，马超就想对士族的势力动手了，只是因为士族是这个社会的历史产物，根深蒂固，绝不是一朝一夕之间便能清除掉的。马超可是很明白，士族的特权，是限制整个社会向前发展的最大障碍，所以他必须要对士族进行打压，改行以军功、战功等功勋为升迁依据的制度。